Proje adı: Bazı fitokimyasallar ile 2019-nCoV spike proteininin reseptör bağlanma bölgesi (RBD) ve konak proteazları [transmembrane protease, serine 2 (TMPRSS2), cathepsin B ve cathepsin L) arasındaki moleküler etkileşimlerin incelenmesi
Bütçe: 45.000 TL
Kurum: TÜBİTAK
Açıklayıcı bilgiler:
Bu çalışmanın amacı, 2019'un son aylarında Çin'de Wuhan şehrinde ortaya çıkan ve 2020'de tüm dünyaya hızla yayılan 2019- nCoV'un spike proteininin ve hücresel proteazların (TMPRSS2, CATB/L) çalışma kapsamında değerlendirilecek olan fitokimyasallarla etkileşimini moleküler docking yöntemleri ile analiz ederek, hem bu alandaki spekülasyonlara son vermek, hem de 2019-nCoV’ye karşı etkili bir ajan bulmaktır. Çalışmada aşağıda verilen hedef fitokimyasallar ile 2019-nCoV'un spike proteininin reseptör bağlanma domaini, TMPRSS2, Cat B ve Cat L arasındaki
i) bağlanma serbest enerjileri,
ii) atomik pozisyonların root-mean-square deviation (RMSD) değerleri,
iii) test edilen fitokimyasalların IC50 değerleri ve
iv) ‘Hit’ ligandların farmakokinetik özellikleri
belirlenecektir.
Çalışma kapsamında ayrıca, fitokimyasalların bağlanma serbest enerjileri, RMSD ve IC50 değerleri arasında korelasyon bulunup bulunmadığı Pearson korelasyon analizi yoluyla belirlenecektir. Çalışma kapsamında değerlendirilmesi planlanan fitokimyasalların yukarıda verilen parametrelerden elde edilecek verilerine ilişkin literatürde herhangi bir rapor bulunmamaktadır. Bu açıdan, elde edilen veriler literatür açısından ilk olma özelliği taşımaktadır. Bu çalışma ile yeni tip koronavirüse karşı yeni ve etkili ilaç adayı moleküllerin aydınlatılacağı düşünülmektedir. Çalışmadan çıkacak sonuçlar etki değeri yüksek saygın uluslar arası dergilerde yayınlanabilme potansiyeline sahiptir.
Prof. Dr. Bektas TEPE
Son Güncelleme: 2020-05-12 15:30:14